機器(委託対応)の詳細情報
Detailed Information of Equipment(Job Request)
機器情報(対応情報) Equipment and Job Request Information | |
---|---|
部署 Affiliation | 医学医療系 医学共通機器室 Institute of Medicine Core Facility |
カテゴリー Category | 生体物質解析装置 Biocompound Analyzers |
機器名(委託内容) Equipment (Job Request) | 次世代シーケンサー Ion PGM System Next-generation sequencer (Ion PGM) |
メーカー(型式) Supplier (Equipment type) | Life Technologies(Ion PGM シーケンサ) Life Technologies (Ion PGM™ System) |
仕様・特徴 Specification・Features |
Ion PGM™は、半導体チップ型のマイクロチップを利用し、DNA伸長反応時の水素イオンを検出する、高速かつ高精度のベンチトップ型次世代シーケンサーである。塩基置換エラーの少ないケミストリを採用し、高精度な変異検出能力と高品質データを算出。1ラン毎にマイクロチップを交換するだけで、スループットを容易に選択することができる拡張性の高いシステムである。 特長 • パフォーマンス:314チップ (200bpリード長時、データ量20Mb)、316チップ (200bpリード長時、データ量200Mb)、318チップ (200bpリード長時、データ量<1Gb) • マルチプレックス対応 : DNA96種類、RNA16種類のバーコードアダプターにより複数検体を一度にシーケンス可能 • ロングリード : 400bpまでの高精度なシーケンス 設置年月日 2013.3.27 Ion PGM™ is the scalable, fastest and higher accuracy bench-top next generation sequencer which uses a semiconductor chip. Ion PGM™ detects a proton which was released in DNA extension step in sequence reaction. Ion PGM™ has higher accuracy of mutation detection and capability of minimized base-change error based on state-of-the-art sequencing chemistry. You can use three type of semiconductor chip for your desired throughput, application. ・ Performance: 314 chip (30-50Mb @ 200bp), 316 chip (300-600Mb @ 200bp), 318 chip (600Mb-1Gb @ 200bp) ・ Multiplex capability: 96 DNA barcode, 16 RNA barcode ・ 400bp high-accuracy sequence is available in all semiconductor chips. Installation date: March 27, 2013 |
設置場所 Installation site | 健康医科学イノベーション棟209室 Room No. 209, Health and Medical Science Innovation Laboratory |
備考 Remark |
<利用上の注意事項> ・利用時間:平日 9:00~17:00 (出入りは利用時間内としますが、月曜~木曜日の退室後の時間外における機器の継続運転は可能です。 時間外継続運転をした場合は、必ず翌日に試料を取りに来てください。) ・本装置の利用は、講習を受講された方に限らせて頂きます。 (本学で講習を受講される場合は、別途講習料が必要となります。) ・利用日の2ヶ月前から予約可能です。 ・窒素ガス以外の消耗品・試薬等は各自でご準備下さい。 ・医学共通機器室を利用するには、共通機器室入室用ICカードが必要です。 機器をご利用の際は、医学守衛室までお立ち寄りください。 |
主な研究成果 Research Accomplishment | |
相談窓口 Inquiry | 利用相談はこちらより必要事項をご記入の上、お問い合わせください。 |
機器担当者 |
担当者:秋山 所属:医学共通機器室 |
利用単価
University-wide Shared Use Rate |
単価 A: 53,910 円 / ラン |
写真 Picture |